近年来最受瞩目的发现或许是婆罗洲云豹，这是200年来首度发现的新种大型猫科动物。动物学家知道云豹在婆罗洲森林里栖息已经一百多年，但认为它们和亚洲大陆（主要是中国、尼泊尔、印度东北部）的云豹属于同一种。
云豹的基因
在分析婆罗洲云豹的基因，并针对毛皮斑纹进行详细评估之后，发现婆罗洲云豹虽在一百多万年前与大陆云豹属于同一个种类，却在此后一百多万年间改变了斑点。
大约140万年前，婆罗洲、爪哇、苏门答腊诸岛与亚洲大陆相连的陆桥被海淹没，将长久以来相连的诸岛隔开，使云豹族群从此分隔开来。随时间推移，留在岛上的云豹渐渐懂得善用它们的雨林栖息地，但爪哇岛上的云豹已经在新石器时代灭绝了。1821年，英国博物学家爱德华·葛瑞菲斯（Edward Griffiths）描述了云豹的特征，西方科学界才知道它们。从犬齿与身体的相对比例来看，它们的犬齿是猫科动物之最。
婆罗洲云豹
（世界自然基金会—佳能 / 阿兰·康波斯特提供）
苏格兰国立博物馆自然科学部的安德鲁·基钦纳（Andrew Kitchener）博士仔细检查过云豹的毛皮，发现大陆云豹与岛屿云豹之间有明显差异。生活在婆罗洲、苏门答腊等地的为婆罗洲云豹，背部会有两道的条纹，且毛色比大陆云豹暗沉。此外，婆罗洲云豹的云状纹比大陆云豹小，而且云状纹里有更多轮廓、更清楚的斑点。
婆罗洲云豹是独立的物种，而不是几十年来所认定的亚种，这一观点得到美国国立癌症研究所史蒂芬·奥布里恩（Stephen O’Brien）博士所领导的基因编码团队的支持。他的团队在两种豹的DNA里找到超过36项重大差异。这两种豹的基因编码差异大，要判断它们不是同一种类并不是很困难。其实它们之间的基因差异，就和狮子与老虎的差异一样大。
婆罗洲云豹
（世界自然基金会—佳能 / 阿兰·康波斯特提供）
据估计，婆罗洲栖息着5000〜11 000只云豹，苏门答腊则有3000〜7000只。估计值的数量差距这么大，说明要发现这种动物有多么困难，对它们的研究又很少。这种离群索居的夜行云豹虽然是婆罗洲岛上最大的捕食动物，却很少现踪，因而研究它们的毛皮斑纹时，不得不以博物馆里收藏的57件毛皮，以及自动照相监测系统所拍下的少数照片为基础。
研究人员表示，云豹斑纹的差异在他们看来十分明显，但是竟然从来没有人注意到，这还真的很奇怪呢。
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